ProSightPD 软件

使用 Thermo Scientific™ ProSightPD™ 软件对自上而下的蛋白质组学数据进行全面分析。ProSightPD 具备强大的蛋白质组学搜索引擎，可用于蛋白质变体表征，包括带有 PTM 或截短的蛋白质变体。ProSightPD 软件可处理任何 Thermo Scientific 质谱仪中的裂解技术产生的蛋白质组学数据。ProSightPD 软件是为数不多的蛋白质组学软件，用户借此可在包含完整生物复杂性（可见于 UniProt 中）的蛋白质组数据库中轻松搜索 MS/MS 数据。

多种功能

一种快速而灵活的蛋白质组学搜索引擎，可同时用于靶向和高通量蛋白鉴定，专为自上而下的蛋白质组学数据而设计。

• 包括五种不同的数据库搜索模式 – 序列标签、单一蛋白和基因限制搜索，能够出色地完成完整蛋白表征。
• 在蛋白质、异构体、蛋白质变体和命中蛋白质变体层面执行错误发现率计算。
• 处理许多不同类型的裂解数据，包括使用 ETD、HCD、EThcD、UVPD、ECD、IRMPD 或 CID 生成的数据。
• 可合并图形片段图，甚至包括具有不同离子类型的片段图。
• 包括获得专利的 ProSight，其中包含所有已知的翻译后修饰 (PTM)、选择性剪接事件和单核苷酸多态性 (SNP)。
• ProSightPD 软件能够提供更可靠的前体离子质量分析，现在已经可以对 FAIMS 和 PTR 数据进行分析。高分辨率和低分辨率数据均可使用 ProSightPD 软件中嵌入的 Xtract 和 ReSpect 算法进行处理，从而使用户能够对广泛范围内的质量（∼1 kDa 至 >150 kDa）进行分析。
• 导入了 XML 和 FASTA 数据库，并且可以采用鸟枪法使用所有可能的修饰对这些数据库进行注释。
• 用户在查看搜索结果和自定义修饰时可以体验到无与伦比的多功能可视化效果，从而查找到更适合的匹配结果。